لحظاتی پیش iOS 9.3.1 برای تمام دستگاه‌هایی که از iOS 9 پشتیبانی می‌کنند، عرضه شد. این نسخه تغییر خاصی نسبت به نسخه قبلی ندارد.

باگ کرش کردن سافاری با کلیک کردن روی بعضی از لینک‌ها در این نسخه رفع شده است. این باگ از طرف مشکلی در سیستم Deep Linking ایجاد می‌شد و با نصب بودن برخی از برنامه‌ها، سافاری دائما کرش می‌کرد.

برای دانلود این نسخه می‌توانید به قسمت Software Update تنظیمات دستگاه خود مراجعه کنید.